ARID4B - ARID4B

ARID4B
Идентификаторы
Псевдонимы	ARID4B, BCAA, BRCAA1, RBBP1L1, RBP1L1, SAP180, AT-богатый домен взаимодействия 4B
Внешние идентификаторы	OMIM: 609696 MGI: 2137512 ГомолоГен: 12847 Генные карты: ARID4B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q42.3 Начинать 235,131,634 бп[1] Конец 235,328,219 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 A1 | 13 5,29 см Начинать 14,063,232 бп[2] Конец 14,199,603 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • активность гистондеацетилазы • молекулярная функция • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • нуклеоплазма • ядро клетки • клеточный компонент Биологический процесс • регулирование экспрессии генов путем генетического импринтинга • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • создание клеточного барьера Сертоли • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • триметилирование гистона H4-K20 • транскрипция, ДНК-шаблон • триметилирование гистона H3-K9 • сперматогенез • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • деацетилирование гистонов • биологический процесс • организация хроматина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51742	94246
Ансамбль	ENSG00000054267	ENSMUSG00000039219
UniProt	Q4LE39	A2CG63
RefSeq (мРНК)	NM_001206794 NM_016374 NM_031371	NM_194262 NM_198122
RefSeq (белок)	NP_001193723 NP_057458 NP_112739	NP_919238 NP_937755
Расположение (UCSC)	Chr 1: 235.13 - 235.33 Мб	Chr 13: 14.06 - 14.2 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

AT-богатый интерактивный домен, содержащий белок 4B это белок что у людей кодируется ARID4B ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует белок с последовательностью, сходной с ретинобластома -связывающий белок-1. Кодируемый белок является субъединицей гистоновая деацетилаза -зависимый SIN3A транскрипционный корепрессор комплекс, который функционирует в различных клеточных процессах, включая распространение, дифференциация, апоптоз, онкогенез, и определение судьбы клетки. Продукт гена признан IgG антитело изолирован от рак молочной железы терпеливым и кажется молекулярный маркер связаны с широким спектром злокачественных новообразований человека. Альтернативная транскрипция сращивание варианты кодирования разные изоформы были охарактеризованы.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000054267 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039219 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Цао Дж., Гао Т., Стэнбридж Э.Дж., Ирие Р. (август 2001 г.). «RBP1L1, ген, связанный с ретинобластомой, связанный с белком, кодирующий антигенный эпитоп, широко экспрессирующийся в карциномах человека и нормальных яичках». J Natl Cancer Inst. 93 (15): 1159–65. Дои:10.1093 / jnci / 93.15.1159. PMID  11481388.
6. «Энтрез Джин: ARID4B AT с богатым интерактивным доменом 4B (подобный RBP1)».

внешняя ссылка

• Человек ARID4B расположение генома и ARID4B страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х., Люнг А. К., Лам Ю. В., Стин Х, Манн М., Ламонд А. И. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298.
• Боммель Х, Се Дж., Россолл В., Визе С., Яблонка С., Бём Т., Сендтнер М. (2003). «Миссенс-мутация в гене тубулин-специфического шаперона E (Tbce) в мышиной мутантной прогрессирующей двигательной нейронопатии, модель болезни мотонейронов человека». J. Cell Biol. 159 (4): 563–9. Дои:10.1083 / jcb.200208001. ЧВК  2173089. PMID  12446740.
• Флейшер Т.К., Юн Ю.Дж., Айер Д.Е. (2003). «Идентификация и характеристика трех новых компонентов корепрессорного комплекса mSin3A». Мол. Клетка. Биол. 23 (10): 3456–67. Дои:10.1128 / MCB.23.10.3456-3467.2003. ЧВК  164750. PMID  12724404.
• Цуй Д., Цзинь Дж., Гао Т., Сан Т., Тиан Ф., Эстрада Г. Г., Гао Х., Сараи А. (2004). «Характеристика BRCAA1 и идентификация его нового антигенного эпитопа». Cancer Epidemiol. Биомаркеры Назад. 13 (7): 1136–45. PMID  15247124.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.