EDEM3 - EDEM3

EDEM3
Идентификаторы
Псевдонимы	EDEM3, C1orf22, усиление деградации ER альфа-маннозидазоподобного белка 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 610214 MGI: 1914217 ГомолоГен: 11866 Генные карты: EDEM3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q25.3 Начинать 184,690,237 бп[1] Конец 184,754,907 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 G1-G2 Начинать 151,755,371 бп[2] Конец 151,822,051 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • гидролазная активность • связывание ионов металлов • маннозил-олигосахарид 1,2-альфа-маннозидазная активность • каталитическая активность Сотовый компонент • просвет эндоплазматического ретикулума • эндоплазматический ретикулум • мембрана • отделение контроля качества эндоплазматического ретикулума Биологический процесс • эндоплазматический ретикулум развернутый белковый ответ • гликозилирование белков • Обработка N-гликанов • ответ на развернутый белок • катаболический процесс гликопротеина • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • тримминг маннозы участвует в пути гликопротеина ERAD Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	80267	66967
Ансамбль	ENSG00000116406	ENSMUSG00000043019
UniProt	Q9BZQ6	Q2HXL6
RefSeq (мРНК)	NM_025191 NM_001319960	NM_001039644 NM_001311165 NM_001311166
RefSeq (белок)	NP_001306889 NP_079467	NP_001034733 NP_001298094 NP_001298095
Расположение (UCSC)	Chr 1: 184.69 - 184.75 Мб	Chr 1: 151.76 - 151.82 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Альфа-маннозидаза-подобная 3, усиливающая деградацию ER является фермент что у людей кодируется EDEM3 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116406 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000043019 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Mast SW, Дикман К., Каравег К., Дэвис А., Сиферс Р.Н., Мормен К.В. (март 2005 г.). «EDEM2 человека, новый гомолог гликозидаз семейства 47, участвует в ER-ассоциированной деградации гликопротеинов». Гликобиология. 15 (4): 421–36. Дои:10.1093 / glycob / cwi014. PMID  15537790.
6. Оливари С., Галли С., Аланен Х., Раддок Л., Молинари М. (январь 2005 г.). «Новый индуцированный стрессом вариант EDEM, регулирующий деградацию гликопротеинов, связанную с эндоплазматическим ретикулумом». J Biol Chem. 280 (4): 2424–8. Дои:10.1074 / jbc.C400534200. PMID  15579471.
7. «Ген Entrez: усилитель деградации EDEM3 ER, маннозидаза альфа-подобная 3».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Суд Р., Боннер Т.И., Макаловска И. и др. (2001). «Клонирование и характеристика 13 новых транскриптов и гена RGS8 человека из области 1q25, охватывающей локус наследственного рака простаты (HPC1)». Геномика. 73 (2): 211–22. Дои:10.1006 / geno.2001.6500. PMID  11318611.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Хирао К., Нацука Ю., Тамура Т. и др. (2006). «EDEM3, растворимый гомолог EDEM, усиливает деградацию гликопротеина, связанную с эндоплазматическим ретикулумом, и обрезку маннозы». J. Biol. Chem. 281 (14): 9650–8. Дои:10.1074 / jbc.M512191200. PMID  16431915.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.