EPS15 - EPS15

EPS15
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1C07, 1EH2, 1F8H, 1FF1, 2IV9, 2JXC, 4RH5, 4RH9, 4RHG, 4S0G, 5JP2
Идентификаторы
Псевдонимы	EPS15, AF-1P, AF1P, MLLT5, субстрат пути рецептора эпидермального фактора роста 15
Внешние идентификаторы	OMIM: 600051 MGI: 104583 ГомолоГен: 128359 Генные карты: EPS15
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п32.3 Начинать 51,354,263 бп[1] Конец 51,519,266 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 C7 Начинать 109,280,268 бп[2] Конец 109,387,817 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • Привязка домена SH3 • связывание ионов металлов • связывание с белками, зависящее от модификации полиубиквитина • GO: 0001948 связывание с белками • связывание кадгерина • идентичное связывание с белками • грузоприемная деятельность Сотовый компонент • эндосома • клатриновое покрытие ямы с покрытием • мембрана ранней эндосомы • мембрана • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • клеточная мембрана • агрессивный • ресничная мембрана • яма, покрытая клатрином • Адаптерный комплекс АП-2 • везикула, покрытая клатрином • базальная плазматическая мембрана • апикальная плазматическая мембрана • ранняя эндосома • цитоплазма • цитозоль • синапс • постсинапс • глутаматергический синапс Биологический процесс • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора эпидермального фактора роста • эндоцитоз • сигнальный путь рецептора эпидермального фактора роста • организация пузырьков • Гольджи к транспорту эндосом • сборка клатринового пальто • транспорт белка • вирусное проникновение • рецептор-опосредованный эндоцитоз вируса клеткой-хозяином • клеточная пролиферация • положительное регулирование рециклинга рецепторов • регулирование пролиферации клеток • эндоцитарный рециклинг • мембранная организация • GO: 0022415 вирусный процесс • транспорт • постсинаптическая интернализация рецепторов нейромедиаторов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2060	13858
Ансамбль	ENSG00000085832	ENSMUSG00000028552
UniProt	P42566	P42567
RefSeq (мРНК)	NM_001159969 NM_001981	NM_001159964 NM_007943
RefSeq (белок)	NP_001153441 NP_001972	NP_001153436 NP_031969
Расположение (UCSC)	Chr 1: 51.35 - 51.52 Мб	Chr 4: 109,28 - 109,39 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субстрат рецептора эпидермального фактора роста 15 это белок что у людей кодируется EPS15 ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует белок, который является частью пути EGFR. Белок присутствует в ямках, покрытых клатрином, и участвует в рецепторном эндоцитозе EGF. Примечательно, что этот ген перегруппирован с геном HRX / ALL / MLL в острые миелогенные лейкозы. Альтернативные варианты сплайсинга транскрипции этого гена наблюдались, но не были полностью охарактеризованы.^[6]

Модельные организмы

Eps15 нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Гомозигота жизнеспособность	Нормальный
Плодородие	Нормальный
Масса тела	Нормальный
Беспокойство	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Горячая тарелка	Нормальный
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Нормальный
Рентгенография	Нормальный
Температура тела	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Нормальный
Плазма иммуноглобулины	Нормальный
Гематология	Аномальный
Лимфоциты периферической крови	Нормальный
Микроядерный тест	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Гистопатология кожи	Нормальный
Гистопатология головного мозга	Нормальный
Гистопатология глаз	Нормальный
Сальмонелла инфекционное заболевание	Нормальный[7]
Citrobacter инфекционное заболевание	Нормальный[8]
Все тесты и анализы от[9][10]

Модельные организмы были использованы при изучении функции EPS15. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Eps15^{tm1a (КОМП) Wtsi[11][12]} был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект мутагенеза с высокой пропускной способностью для создания и распространения животных моделей болезней среди заинтересованных ученых - в Wellcome Trust Sanger Institute.^[13][14][15]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.^[9][16] Было проведено 26 испытаний мутант мышей, и наблюдалась одна значительная аномалия: гомозиготный мутантные животные имели пониженную среднюю корпускулярную гемоглобин концентрация.^[9]

Взаимодействия

EPS15 показал взаимодействовать с:

• CRK^[17]
• EPN1,^[18]
• HGS,^[19][20]
• HRB,^[21] и
• REPS2.^[22]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000085832 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028552 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Wong WT, Kraus MH, Carlomagno F, Zelano A, Druck T, Croce CM, Huebner K, Di Fiore PP (июнь 1994 г.). «Ген eps15 человека, кодирующий субстрат тирозинкиназы, является консервативным в процессе эволюции и отображается на 1p31-p32». Онкоген. 9 (6): 1591–7. PMID  8183552.
6. «Ген Entrez: субстрат 15 пути рецептора эпидермального фактора роста EPS15».
7. "Сальмонелла данные о заражении для Eps15 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
8. "Citrobacter данные о заражении для Eps15 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
9. Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88 (S248). Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
10. Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
11. «Международный консорциум нокаут-мышей».
12. "Информатика генома мыши".
13. Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт АФ, Брэдли А (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
14. Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
15. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
16. ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
17. Шумахер К., Кнудсен Б.С., Охучи Т., Ди Фиоре П.П., Глассман Р.Х., Ханафуса Н. (июнь 1995 г.). «Домен SH3 Crk специфически связывается с консервативным мотивом, богатым пролином в Eps15 и Eps15R». J. Biol. Chem. 270 (25): 15341–7. Дои:10.1074 / jbc.270.25.15341. PMID  7797522.
18. Чен Х., Фре С., Слепнев В.И., Капуа М.Р., Такей К., Батлер М.Х., Ди Фьоре П.П., Де Камилли П. (август 1998 г.). «Эпсин представляет собой белок, связывающий ЕН-домен, участвующий в клатрин-опосредованном эндоцитозе». Природа. 394 (6695): 793–7. Дои:10.1038/29555. PMID  9723620.
19. Бин А.Дж., Давангер С., Чоу М.Ф., Герхардт Б., Цудзимото С., Чанг И. (май 2000 г.). «Hrs-2 ​​регулирует рецептор-опосредованный эндоцитоз посредством взаимодействия с Eps15». J. Biol. Chem. 275 (20): 15271–8. Дои:10.1074 / jbc.275.20.15271. PMID  10809762.
20. Бач К.Г., Райборг С., Мехлум А., Стенмарк Н. (апрель 2003 г.). «STAM и Hrs представляют собой субъединицы поливалентного убиквитин-связывающего комплекса на ранних эндосомах». J. Biol. Chem. 278 (14): 12513–21. Дои:10.1074 / jbc.M210843200. PMID  12551915.
21. Дориа М., Сальчини А.Е., Коломбо Е., Парслоу Т.Г., Пеличчи П.Г., Ди Фьоре П.П. (декабрь 1999 г.). «Основанное на домене гомологии eps15 (EH) взаимодействие между eps15 и hrb связывает молекулярный механизм эндоцитоза с механизмом нуклеоцитозольного транспорта». J. Cell Biol. 147 (7): 1379–84. Дои:10.1083 / jcb.147.7.1379. ЧВК  2174238. PMID  10613896.
22. Накашима С., Моринака К., Кояма С., Икеда М., Кишида М., Окава К., Ивамацу А., Кишида С., Кикучи А. (июль 1999 г.). «Малый G-белок Ral и его нижележащие молекулы регулируют эндоцитоз EGF и рецепторов инсулина». EMBO J. 18 (13): 3629–42. Дои:10.1093 / emboj / 18.13.3629. ЧВК  1171441. PMID  10393179.

дальнейшее чтение

• Шумахер К., Кнудсен Б.С., Охучи Т., Ди Фиоре П.П., Глассман Р.Х., Ханафуса Н. (1995). «Домен SH3 Crk специфически связывается с консервативным мотивом, богатым пролином в Eps15 и Eps15R». J. Biol. Chem. 270 (25): 15341–7. Дои:10.1074 / jbc.270.25.15341. PMID  7797522.
• Бернард О.А., Мошоф М., Мекуччи С., Ван ден Берге Х., Бергер Р. (1994). «Новый ген AF-1p, слитый с HRX в t (1; 11) (p32; q23), не связан ни с AF-4, ни с AF-9, ни с ENL». Онкоген. 9 (4): 1039–45. PMID  8134107.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Benmerah A, Bégue B, Dautry-Varsat A, Cerf-Bensussan N (1996). «Ухо альфа-адаптина взаимодействует с COOH-концевым доменом белка Eps 15». J. Biol. Chem. 271 (20): 12111–6. Дои:10.1074 / jbc.271.20.12111. PMID  8662627.
• Мацуда М., Ота С., Танимура Р., Накамура Х., Матуока К., Такенава Т., Нагашима К., Курата Т. (1996). «Взаимодействие между аминоконцевым SH3-доменом CRK и его естественными белками-мишенями». J. Biol. Chem. 271 (24): 14468–72. Дои:10.1074 / jbc.271.24.14468. PMID  8662907.
• ван Делфт С., Шумахер С., Хаге В., Ферклей А.Дж., ван Берген ан Хенегувен П.М. (1997). «Ассоциация и совместная локализация Eps15 с адаптерным белком-2 и клатрином». J. Cell Biol. 136 (4): 811–21. Дои:10.1083 / jcb.136.4.811. ЧВК  2132490. PMID  9049247.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Ю. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Тебар Ф, Конфалониери С., Картер Р. Э., Ди Фьоре П. П., Соркин А. (1997). «Eps15 конститутивно олигомеризуется из-за гомофильного взаимодействия его области спиральной спирали». J. Biol. Chem. 272 (24): 15413–8. Дои:10.1074 / jbc.272.24.15413. PMID  9182572.
• Сальчини А.Е., Конфалониери С., Дориа М., Сантолини Е., Тасси Е., Миненкова О., Чезарени Дж., Пеличчи П. Г., Ди Фиоре П. П. (1997). «Специфичность связывания и мишени in vivo для домена EH, новый модуль межбелкового взаимодействия». Genes Dev. 11 (17): 2239–49. Дои:10.1101 / gad.11.17.2239. ЧВК  275390. PMID  9303539.
• Куперс П., тер Хаар Э, Болл В., Кирххаузен Т. (1998). «Параллельные димеры и антипараллельные тетрамеры, образованные клоном 15 субстрата пути рецептора эпидермального фактора роста». J. Biol. Chem. 272 (52): 33430–4. Дои:10.1074 / jbc.272.52.33430. PMID  9407139.
• Хаффнер К., Такей К., Чен Х, Рингстад ​​Н., Хадсон А., Батлер М. Х., Сальчини А. Э., Ди Фиоре П. П., Де Камилли П. (1998). «Синаптоянин 1: локализация на покрытых оболочкой эндоцитарных интермедиатах в нервных окончаниях и взаимодействие его изоформы 170 кДа с Eps15». FEBS Lett. 419 (2–3): 175–80. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 01451-8. PMID  9428629.
• Benmerah A, Lamaze C, Bègue B, Schmid SL, Dautry-Varsat A, Cerf-Bensussan N (1998). «Взаимодействие AP-2 / Eps15 необходимо для рецептор-опосредованного эндоцитоза». J. Cell Biol. 140 (5): 1055–62. Дои:10.1083 / jcb.140.5.1055. ЧВК  2132690. PMID  9490719.
• де Бир Т., Картер Р. Э., Лобель-Райс К. Э., Соркин А., Овердуин М. (1998). «Структура и карман связывания Asn-Pro-Phe гомологического домена Eps15». Наука. 281 (5381): 1357–60. Дои:10.1126 / science.281.5381.1357. PMID  9721102.
• Чен Х, Фре С., Слепнев В.И., Капуа М.Р., Такей К., Батлер М.Х., Ди Фиоре П.П., Де Камилли П. (1998). «Эпсин представляет собой белок, связывающий ЕН-домен, участвующий в клатрин-опосредованном эндоцитозе». Природа. 394 (6695): 793–7. Дои:10.1038/29555. PMID  9723620.
• Левин Д.А., Шефф Д., Оои К.Э., Уитни Дж. А., Ямамото Е., Чичионе Л. М., Вебстер П., Бонифачино Дж. С., Меллман И. (1998). «Клонирование, экспрессия и локализация новой молекулы, подобной гамма-адаптину». FEBS Lett. 435 (2–3): 263–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 01083-7. PMID  9762922.
• Сенгар А.С., Ван В., Бишай Дж, Коэн С., Иган С.Е. (1999). «Белки Ese доменов EH и SH3 регулируют эндоцитоз, связываясь с динамином и Eps15». EMBO J. 18 (5): 1159–71. Дои:10.1093 / emboj / 18.5.1159. ЧВК  1171207. PMID  10064583.
• Poupon V, Bègue B, Gagnon J, Dautry-Varsat A, Cerf-Bensussan N, Benmerah A (1999). «Молекулярное клонирование и характеристика MT-ACT48, новой митохондриальной ацил-CoA тиоэстеразы». J. Biol. Chem. 274 (27): 19188–94. Дои:10.1074 / jbc.274.27.19188. PMID  10383425.
• Накашима С., Моринака К., Кояма С., Икеда М., Кишида М., Окава К., Ивамацу А., Кишида С., Кикучи А. (1999). «Малый G-белок Ral и его нижележащие молекулы регулируют эндоцитоз EGF и рецепторов инсулина». EMBO J. 18 (13): 3629–42. Дои:10.1093 / emboj / 18.13.3629. ЧВК  1171441. PMID  10393179.
• Стивенс DJ, Бантинг Дж. (1999). «Прямое взаимодействие мембранного белка транс-сети Гольджи, TGN38, с белком, связывающим F-актин, нейрабином». J. Biol. Chem. 274 (42): 30080–6. Дои:10.1074 / jbc.274.42.30080. PMID  10514494.