EXTL2 - EXTL2

EXTL2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1OMX, 1ОМЗ, 1ON6, 1ON8
Идентификаторы
Псевдонимы	EXTL2, EXTR2, экзостозин-подобная гликозилтрансфераза 2, экзостозин-подобная гликозилтрансфераза 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602411 MGI: 1889574 ГомолоГен: 1102 Генные карты: EXTL2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п21.2 Начинать 100,872,372 бп[1] Конец 100,895,179 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 G1 Начинать 116,007,462 бп[2] Конец 116,029,017 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • глюкуронил-галактозил-протеогликан 4-альфа-N-ацетилглюкозаминилтрансферазная активность • связывание ионов металлов • трансферазная активность, перенос гликозильных групп • связывание гликозаминогликанов • связывание ионов марганца • альфа-1,4-N-ацетилгалактозаминилтрансферазная активность • глюкуронилгалактозилпротеогликан 4-бета-N-ацетилгалактозаминилтрансферазная активность Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • внеклеточная область • эндоплазматический ретикулум • мембрана • мембрана эндоплазматического ретикулума Биологический процесс • процесс биосинтеза протеогликана гепарансульфата • Метаболический процесс N-ацетилглюкозамина • УДФ-N-ацетилгалактозамин метаболический процесс • IRE1-опосредованный ответ развернутого белка • гликозилирование белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2135	58193
Ансамбль	ENSG00000162694	ENSMUSG00000027963
UniProt	Q9UBQ6	Q9ES89
RefSeq (мРНК)	NM_001033025 NM_001261440 NM_001261441 NM_001261442 NM_001439	NM_001163514 NM_001163515 NM_021388
RefSeq (белок)	NP_001028197 NP_001248369 NP_001248370 NP_001248371 NP_001430	NP_001156986 NP_001156987 NP_067363
Расположение (UCSC)	Chr 1: 100,87 - 100,9 Мб	Chr 3: 116.01 - 116.03 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Экзостозин-подобный 2 это белок что у людей кодируется EXTL2 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162694 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027963 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Вуйтс В., Ван Хул В., Хендриккс Дж., Спелеман Ф., Ваутерс Дж., Де Буль К., Ван Рой Н., Ван Агтмаэль Т., Боссайт П., Виллемс П. Дж. (Март 1998 г.). «Идентификация и характеристика нового члена семейства генов EXT, EXTL2». Eur J Hum Genet. 5 (6): 382–9. Дои:10.1159/000484796. PMID  9450183.
6. Собхани М., Донг Дж., Негиши М. (июнь 2005 г.). «Двухступенчатый механизм, определяющий специфичность связывания донора UDP-N-ацетилгексозаминилтрансферазы человека». J Biol Chem. 280 (25): 23441–5. Дои:10.1074 / jbc.M413379200. PMID  15831490.
7. "Entrez Gene: EXTL2 экзостозы (множественные) -подобные 2".

дальнейшее чтение

• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Маккормик C, Дункан G, Goutsos KT, Tufaro F (2000). «Предполагаемые опухолевые супрессоры EXT1 и EXT2 образуют стабильный комплекс, который накапливается в аппарате Гольджи и катализирует синтез гепарансульфата». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (2): 668–73. Дои:10.1073 / пнас.97.2.668. ЧВК  15388. PMID  10639137.
• Китагава Х., Шимакава Х., Сугахара К. (1999). «Супрессор опухоли EXT-подобный ген EXTL2 кодирует альфа1, 4-N-ацетилгексозаминилтрансферазу, которая переносит N-ацетилгалактозамин и N-ацетилглюкозамин в общую область связи гликозаминогликан-белок. Ключевой фермент для инициации цепи гепарансульфата». J. Biol. Chem. 274 (20): 13933–7. Дои:10.1074 / jbc.274.20.13933. PMID  10318803.
• Сайто Т., Секи Н., Ямаути М. и др. (1998). «Структура, хромосомное положение и профиль экспрессии EXTR1 и EXTR2, новых членов семейства генов множественных экзостозов». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 243 (1): 61–6. Дои:10.1006 / bbrc.1997.8062. PMID  9473480.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Mouse Exostosin-like 2