2 фунта стерлингов - GBP2

2 фунта стерлингов
Идентификаторы
Псевдонимы	2 фунта стерлингов, гуанилат-связывающий белок 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 600412 MGI: 102772 ГомолоГен: 10289 Генные карты: 2 фунта стерлингов
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1p22.2 Начинать 89,106,132 бп[1] Конец 89,150,456 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 H1 | 3 66,69 см Начинать 142,620,602 бп[2] Конец 142,638,008 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание GTP • GO: 0001948 связывание с белками • гидролазная активность • ГТФазная активность • активность гомодимеризации белков Сотовый компонент • Мембрана Гольджи • мембрана • нуклеоплазма • цитозоль • актиновый цитоскелет • ядро клетки • цитоплазма • аппарат Гольджи • перинуклеарная область цитоплазмы • симбионтсодержащая вакуумная мембрана • цитоплазматический пузырек Биологический процесс • сигнальный путь интерферона I типа • иммунная реакция • интерферон-гамма-опосредованный сигнальный путь • локализация белка в ядре • клеточный ответ на гамма-интерферон • клеточный ответ на интерлейкин-1 • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • защитный ответ на простейшие • защитный ответ на грамположительные бактерии Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2634	14469
Ансамбль	ENSG00000162645	ENSMUSG00000028270
UniProt	P32456	Q9Z0E6
RefSeq (мРНК)	NM_004120	NM_010260
RefSeq (белок)	NP_004111	NP_034390
Расположение (UCSC)	Chr 1: 89.11 - 89.15 Мб	Chr 3: 142,62 - 142,64 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Интерферон-индуцированный гуанилат-связывающий белок 2 это белок что у людей кодируется 2 фунта стерлингов ген.^[5][6] GBP2 - это ген, относящийся к суперсемейству больших GTPases, которые могут индуцироваться в основном интерфероном гамма.^[7]

Локализация

Ген GBP2 расположен в различных компартментах клетки: ядро, цитозоль и цитоскелет а также димер GBP2-GBP5 локализуется на аппарат Гольджи.^[8]

В дополнение Изопренилирование требуется для регулирования внутриклеточный локализация и мембрана ассоциация GBP2.^[9]

Активация

В мышиный Ген GBP2 не просто сильно активируется интерферон-гамма в течение макрофаги активации, но также и стимуляцией Толл-подобные рецепторы, Фактор некроза опухоли (TNF) и Интерлейкин 1 бета.^[10]

Выражение

После стимуляции интерфероном гамма мышиный GPB2 экспрессируется в врожденный и адаптивные иммунные клетки.^[11]

Структура

Анализ последовательности GBP2 показал наличие РНК связывающий домен, который включает три мотива узнавания РНК (RRM) и домен SR. Аминоконец GBp2 имеет четыре мотива повтора Arg-Gly-Gly (RGG) и девять остатков серина в контексте мотивов аргинина / серина.^[12]

Домен SR для GBP2 - это фосфорилирование сайт для SR-специфической протеинкиназы SRPK (sky1), которая определяет ядерную локализацию GBP2.^[12]

Свиной GBP2 имеет большое сходство в отношении N-конца, который представляет собой шаровидный домен и содержать GTPase функция. Однако на С-конце присутствует спиральный домен, который менее консервативен.^[13]

Взаимодействие

Ген GBP2 может взаимодействовать с РНК через домен RRM1 и RRM2. Домен RRM2 может распознавать основной мотив GGUC, присутствующий в РНК. Кроме того, идентифицирован новый тип домена RRM, который может взаимодействовать с комплексом THO / TREX.^[14]

Ген GBp2 может взаимодействовать с комплексом TREX (транскрипция-экспорт); а мультимерный комплекс имеет разные фактор транскрипции и факторы экспорта, такие как Yra1 и Sub2.^[14]

Функция

Интерфероны находятся цитокины который имеет противовирусное средство эффекты и подавление опухоли распространение клеток. Они вызывают большое количество гены в своих клетках-мишенях, включая те, которые кодируют гуанилат-связывающие белки (Фунты стерлингов). GBP характеризуются своей способностью специфически связывать гуаниновые нуклеотиды (GMP, ВВП, и GTP ). Белок, кодируемый этим геном, представляет собой GTPase который преобразует GTP в GDP и GMP.^[6] Кроме того, ген GBP2 может быть взаимосвязью между рецептор клеточной поверхности и внутриклеточные эффекторы, которые могут передавать внеклеточную информацию в клетки, а также внутриклеточный сигнал трансдукция белок.^[15]

Исследование гена GBP2 крупного рогатого скота показало важность GBP2 в регуляции пролиферации клеток и устойчивости к патогенной инфекции, такой как проявление противовирусной активности против вируса гриппа.^[11]

GPB2 Содействовать окислительному уничтожению и доставить противомикробный пептиды к аутофаголизосома l, обеспечивая широкую защиту хоста от различных возбудитель классы. Во время вирусной инфекции семейство GBPs (GBP1, GBP2 и GBP5) играет жизненно важную роль для активации канонических и неканонических воспаление реагировать на инфекцию патогена через Chlamydia muridarum.^[16]

Клиническое значение

Генная мутация

А миссенс-мутация GBP2 (A907G) был обнаружен у пациентов с мигренью. На первом этапе может возникнуть вазомоторная дисфункция, а затем и головные боли.^[15]

Рак молочной железы

GBP2 считается фактором контроля пролиферации и распространения в опухолевой клетке. Высокая экспрессия GBP2 связана с лучшей диагностикой рака груди. P53 может активизировать GBP2 и играют важную роль в опухоль развитие путем торможения металлопротеиназа MM9, а также NF-Kappa B и белок Rac.^[17]

Уровень транскрипции GBP2 также регулируется двумя факторами транскрипции. STAT1 и IRF1. Экспрессия GBP2 имеет сильную корреляцию с метагеном Т-клеток, который, по-видимому, связан с инфильтрацией Т-клетка в рак молочной железы.^[17]

Однако недавнее исследование показало, что GBP2 может регулировать динамин -связанный белок 1 (Drp1) для блокирования транслокации Drp1 к митохондрии что приводит к ослаблению зависимого от Drp1 деление митохондрий а также вторжение клеток рака груди.^[18]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162645 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028270 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Cheng YS, Patterson CE, Staeheli P (сентябрь 1991 г.). «Интерферон-индуцированные связывающие гуанилат белки лишены консенсусного мотива N (T) KXD и ​​связывают GMP в дополнение к GDP и GTP». Молекулярная и клеточная биология. 11 (9): 4717–25. Дои:10.1128 / mcb.11.9.4717. ЧВК  361367. PMID  1715024.
6. «Ген Entrez: гуанилат-связывающий белок 2 GBP2, интерферон-индуцируемый».
7. Ким Б.Х., Шеной А.Р., Кумар П., Брэдфилд С.Дж., МакМикинг Д.Д. (октябрь 2012 г.). «IFN-индуцируемые GTPases в защите клетки-хозяина». Клеточный хозяин и микроб. 12 (4): 432–44. Дои:10.1016 / j.chom.2012.09.007. ЧВК  349020. PMID  23084913.
8. "GBP2 Gene". GeneCards База данных генов человека. Получено 2018-11-07.
9. Бритцен-Лоран Н., Бауэр М., Бертон В., Фишер Н., Сыгуда А., Рейпшлегер С., Нашбергер Е., Херрманн С., Штюрцль М. (декабрь 2010 г.). «Внутриклеточное перемещение гуанилат-связывающих белков иерархически регулируется гетеродимеризацией». PLOS One. 5 (12): e14246. Дои:10.1371 / journal.pone.0014246. ЧВК  2998424. PMID  21151871.
10. Дегранди Д., Кравец Э., Конерманн С., Бойтер-Гуния С., Клюмперс В., Ламе С., Вишманн Э., Маусберг А. К., Бир-Хаммер С., Пфеффер К. (январь 2013 г.). «Мышиный гуанилат-связывающий белок 2 (mGBP2) контролирует репликацию Toxoplasma gondii». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 110 (1): 294–9. Дои:10.1073 / pnas.1205635110. ЧВК  3538222. PMID  23248289.
11. Praefcke GJ (ноябрь 2017 г.). «Регулирование врожденных иммунных функций с помощью белков, связывающих гуанилат». Международный журнал медицинской микробиологии. 308: 237–245. Дои:10.1016 / j.ijmm.2017.10.013. PMID  29174633.
12. Windgassen M, Krebber H (март 2003 г.). «Идентификация Gbp2 как нового поли (A) + РНК-связывающего белка, участвующего в цитоплазматической доставке информационных РНК в дрожжах». Отчеты EMBO. 4 (3): 278–83. Дои:10.1038 / sj.embor.embor763. ЧВК  1315891. PMID  12634846.
13. Ма Г, Хуанг Дж., Сун Н, Лю X, Чжу М., Ву З, Чжао С. (май 2008 г.). «Молекулярная характеристика генов GBP1 и GBP2 свиней». Молекулярная иммунология. 45 (10): 2797–807. Дои:10.1016 / j.molimm.2008.02.007. PMID  18346789.
14. Мартинес-Лумбрерас С., Тавернити V, Зоррилла С., Серафин Б., Перес-Каньядильяс Дж. М. (январь 2016 г.). «Gbp2 взаимодействует с THO / TREX через новый тип домена RRM». Исследования нуклеиновых кислот. 44 (1): 437–48. Дои:10.1093 / нар / gkv1303. ЧВК  4705658. PMID  26602689.
15. Цзян, Юэ (январь 2016 г.). «Шесть новых редких несинонимичных мутаций мигрени без ауры, идентифицированных секвенированием экзома». Журнал нейрогенетики. 29: 188–194. Дои:10.3109/01677063.2015.1122787.
16. Man SM, Place DE, Kuriakose T, Kanneganti TD (январь 2017 г.). «Интерферон-индуцируемые гуанилат-связывающие белки на стыке клеточно-автономного иммунитета и активации инфламмасом». Журнал биологии лейкоцитов. 101 (1): 143–150. Дои:10.1189 / jlb.4MR0516-223R. ЧВК  6608036. PMID  27418355.
17. Годой П., Каденас С., Хеллвиг Б., Марчан Р., Стюарт Дж., Рейф Р., Лор М., Герман М., Раненфюрер Дж., Шмидт М., Хенгстлер Дж. Г. (июль 2014 г.). «Интерферон-индуцируемый связывающий гуанилат белок (GBP2) связан с лучшим прогнозом при раке груди и указывает на эффективный Т-клеточный ответ». Рак молочной железы. 21 (4): 491–9. Дои:10.1007 / s12282-012-0404-8. PMID  23001506.
18. Чжан Дж, Чжан И, Ву В, Ван Ф, Лю Х, Шуй Дж, Не Си (октябрь 2017 г.). «Гуанилат-связывающий белок 2 регулирует Drp1-опосредованное деление митохондрий для подавления инвазии клеток рака груди». Смерть и болезнь клеток. 8 (10): e3151. Дои:10.1038 / cddis.2017.559. ЧВК  5680924. PMID  29072687.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Neun R, Richter MF, Staeheli P, Schwemmle M (июль 1996 г.). «ГТФазные свойства индуцированного интерфероном человеческого гуанилат-связывающего белка 2». Письма FEBS. 390 (1): 69–72. Дои:10.1016 / 0014-5793 (96) 00628-X. PMID  8706832.
• Ницше Э.М., Мокин А., Адамс П.С., Генетт Р.С., Лакинс Дж. Н., Синнекер Г. Х., Круз К., Теннисвуд МП (май 1996 г.). «Дифференциальный дисплей RT PCR общей РНК из фибробластов крайней плоти человека для исследования андрогензависимой экспрессии генов». Американский журнал медицинской генетики. 63 (1): 231–8. Дои:10.1002 / (SICI) 1096-8628 (19960503) 63: 1 <231 :: AID-AJMG40> 3.0.CO; 2-M. PMID  8723115.
• Vestal DJ, Горбачева В.Ю., Сен GC (ноябрь 2000). «Различные субклеточные локализации для связанных интерферон-индуцированных GTPases, MuGBP-1 и MuGBP-2: значение для различных функций?». Журнал исследований интерферона и цитокинов. 20 (11): 991–1000. Дои:10.1089/10799900050198435. PMID  11096456.
• Лукасевич Р., Веласкес-Донес А., Хюин Н., Хагопиан Дж., Фу XD, Адамс Дж., Гош Г. (август 2007 г.). «Уникальные по структуре серин-аргининовые протеинкиназы дрожжей и млекопитающих катализируют эволюционно консервативные реакции фосфорилирования». Журнал биологической химии. 282 (32): 23036–43. Дои:10.1074 / jbc.M611305200. PMID  17517895.