LARP4 - LARP4

LARP4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2CQK, 3ПКН
Идентификаторы
Псевдонимы	LARP4, PP13296, член семейства La-рибонуклеопротеиновых доменов 4
Внешние идентификаторы	MGI: 2443114 ГомолоГен: 19173 Генные карты: LARP4
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[1] Группа 15 | 15 F1 Начинать 99,970,065 бп[1] Конец 100,016,358 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • поли (А) переплет • Связывание РНК Сотовый компонент • мембрана • полисом • Гранула стресса • цитозольная малая рибосомная субъединица • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • регуляция морфогенеза клеток • организация цитоскелета • положительное регулирование перевода • биосинтез белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	113251	207214
Ансамбль	ENSG00000161813	ENSMUSG00000023025
UniProt	Q71RC2	Q8BWW4
RefSeq (мРНК)	NM_001170803 NM_001170804 NM_001170808 NM_052879 NM_199188 NM_199190 NM_001330415	NM_001024526 NM_001080948 NM_001284521 NM_001284522 NM_001284523
RefSeq (белок)	NP_001164274 NP_001164275 NP_001164279 NP_001317344 NP_443111 NP_954658 NP_954660 NP_001339233 NP_001339234 NP_001339235 NP_001339236 NP_001339237 NP_001339238 NP_001339239 NP_001339240 NP_001339241 NP_001339242 NP_001339243 NP_001339244 NP_001339245 NP_001339246 NP_001339247 NP_001339248 NP_001339249 NP_001339250 NP_001339251 NP_001339252 NP_001339253 NP_001339254 NP_001339255	NP_001019697 NP_001074417 NP_001271450 NP_001271451 NP_001271452
Расположение (UCSC)	н / д	Chr 15: 99.97 - 100.02 Мб
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

La-родственный белок 4 это белок что в люди кодируется LARP4 ген.^[4][5] LARP4 представляет собой РНК-связывающий белок, который состоит из мотива La (LaM), мотива распознавания РНК (RRM) и предполагаемого мотива связывания PABP. Было показано, что LARP4 участвует в стабильности мРНК.^[6]

Известно, что LARP4 регулирует миграцию и инвазию раковых клеток путем изменения формы клеток.^[7] Сообщается также, что он подавляет опухоль глиомы.^[8]

Рекомендации

1. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023025 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, et al. (Декабрь 2002 г.). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
5. «Ген Entrez: семейство домена рибонуклеопротеина LARP4 La, член 4».
6. Ян Р., Гайдамаков С.А., Се Дж., Ли Дж., Мартино Л., Козлов Г., Кроуфорд А.К., Руссо А.Н., Конте М.Р., Геринг К., Марая Р.Дж. (февраль 2011 г.). «La-родственный белок 4 связывает поли (A), взаимодействует с доменом MLLE поли (A)-связывающего белка через вариантный мотив PAM2w и может способствовать стабильности мРНК». Молекулярная и клеточная биология. 31 (3): 542–56. Дои:10.1128 / MCB.01162-10. ЧВК  3028612. PMID  21098120.
7. Ситхараман С., Флеминг Э., Шен Дж., Конте М.Р., Ридли А.Дж. (ноябрь 2016 г.). «РНК-связывающий белок LARP4 регулирует миграцию и инвазию раковых клеток». Цитоскелет. 73 (11): 680–690. Дои:10.1002 / см 21336. ЧВК  5111583. PMID  27615744.
8. Косо Х, Йи Х, Шеридан П., Мияно С., Ино И, Тодо Т., Ватанабе С. (апрель 2016 г.). «Идентификация РНК-связывающего белка LARP4B как опухолевого супрессора в глиоме». Исследования рака. 76 (8): 2254–64. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-15-2308. PMID  26933087.

дальнейшее чтение

• Ставрака С, Благден С (октябрь 2015 г.). "Связанные с La белки, семья, имеющая отношение к раку". Биомолекулы. 5 (4): 2701–22. Дои:10.3390 / biom5042701. ЧВК  4693254. PMID  26501340.
• Kralovics R, Skoda RC (январь 2005 г.). "Молекулярный патогенез миелопролиферативных нарушений, отрицательных по филадельфийской хромосоме". Отзывы о крови. 19 (1): 1–13. Дои:10.1016 / j.blre.2004.02.002. PMID  15572213.
• Puigdecanet E, Espinet B, Villa O, Florensa L, Besses C, Serrano S, Solé F (май 2006 г.). «Обнаружение аномалий генов PRV-1, TPO и c-MPL, обнаруженных с помощью флуоресцентной гибридизации in situ при эссенциальной тромбоцитемии». Генетика и цитогенетика рака. 167 (1): 39–42. Дои:10.1016 / j.cancergencyto.2005.08.016. PMID  16682284.
• Ван Д, Гун И, Цинь В, Чжан П, Ли Дж, Вэй Л, Чжоу Х, Ли Х, Цю Х, Чжун Ф, Хэ Л, Ю Дж, Яо Г, Цзян Х, Цянь Л, Ю Й, Шу Х , Чен X, Сюй Х, Го М, Пан З, Чен И, Ге Ц, Ян С., Гу Дж (ноябрь 2004 г.). «Крупномасштабный скрининг трансфекции кДНК генов, связанных с развитием и прогрессированием рака». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (44): 15724–9. Bibcode:2004PNAS..10115724W. Дои:10.1073 / pnas.0404089101. ЧВК  524842. PMID  15498874.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Геномные исследования. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.