RIOX1 - RIOX1

RIOX1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4CCJ, 4CCK, 4CCM, 4CCN, 4CCO, 4DIQ, 4E4H, 4Y4R, 4Y33, 4Y3O
Идентификаторы
Псевдонимы	RIOX1, MAPJD, NO66, ROX, hsNO66, URLC2, C14orf169, открытая рамка считывания 169 хромосомы 14, рибосомная оксигеназа 1, JMJD9
Внешние идентификаторы	OMIM: 611919 MGI: 1919202 ГомолоГен: 11366 Генные карты: RIOX1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q24.3 Начинать 73,490,933 бп[1] Конец 73,493,394 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 | 12 D1 Начинать 83,950,608 бп[2] Конец 83,952,951 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • активность диоксигеназы • связывание ионов металлов • активность гистон-деметилазы (специфическая для H3-K4) • активность гистон-деметилазы (специфическая для H3-K36) • оксидоредуктазная активность, действующая на парные доноры, с включением или восстановлением молекулярного кислорода, 2-оксоглутарат в качестве одного донора и включение одного атома кислорода в оба донора • связывание ионов железа Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки • ядрышко Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • окислительно-восстановительный процесс • транскрипция, ДНК-шаблон • деметилирование гистона H3-K4 • деметилирование гистона H3-K36 • ремоделирование хроматина • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция дифференцировки остеобластов • гидроксилирование пептидиларгинина • организация хроматина Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	79697	71952
Ансамбль	ENSG00000170468	ENSMUSG00000046791
UniProt	Q9H6W3	Q9JJF3
RefSeq (мРНК)	NM_024644	NM_023633
RefSeq (белок)	NP_078920	NP_076122
Расположение (UCSC)	Chr 14: 73.49 - 73.49 Мб	Chr 12: 83.95 - 83.95 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Рибосомальная оксигеназа 1 это белок что у человека кодируется RIOX1 ген.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000170468 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000046791 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: открытая рамка считывания 169 хромосомы 14». Получено 2016-04-09.

дальнейшее чтение

• Eilbracht J, Reichenzeller M, Hergt M, Schnölzer M, Heid H, Stöhr M, Franke WW, Schmidt-Zachmann MS (2004). «NO66, высококонсервативный белок с двойным расположением в ядрышке и в особом типе синхронно реплицирующегося хроматина». Мол. Биол. Клетка. 15 (4): 1816–32. Дои:10.1091 / mbc.E03-08-0623. ЧВК  379278. PMID  14742713.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческой рибосомальной оксигеназы 1 (RIOX1)