SLURP1 - SLURP1

SLURP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2MUP, 2MUO
Идентификаторы
Псевдонимы	SLURP1, ANUP, ARS, ArsB, LY6LS, MDM, секретируемый домен LY6 / PLAUR, содержащий 1, LY6-MT
Внешние идентификаторы	OMIM: 606119 MGI: 1930923 ГомолоГен: 10710 Генные карты: SLURP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q24.3 Начните 142,740,949 бп[1] Конец 142,742,406 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 D3 Начните 74,724,318 бп[2] Конец 74,728,034 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • цитокиновая активность • активность активатора ацетилхолиновых рецепторов • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • внеклеточный • внеклеточная область Биологический процесс • клеточная адгезия • отрицательная регуляция пролиферации кератиноцитов • нервно-мышечный процесс, контролирующий осанку • двигательное поведение • активация клеток • отрицательное регулирование пролиферации клеток • отрицательное регулирование миграции клеток • сигнальный путь активатора плазминогена урокиназы • положительная регуляция активности рецепторов • регуляция рецепторной активности • регуляция активности рецепторов нейромедиаторов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	57152	57277
Ансамбль	ENSG00000126233	ENSMUSG00000022596
UniProt	P55000	Q9Z0K7
RefSeq (мРНК)	NM_020427	NM_020519
RefSeq (белок)	NP_065160	NP_065265
Расположение (UCSC)	Chr 8: 142,74 - 142,74 Мб	Chr 15: 74,72 - 74,73 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Секретируемый Ly-6 / uPAR-родственный белок 1 это белок что у людей кодируется SLURP1 ген.^[5][6][7] Он оказывает противовоспалительное действие, действует как супрессор опухолей и противодействует никотиновым рецепторам.^[8]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства Ly6 / uPAR, но не имеет GPI-якорной сигнальной последовательности. Он выделяется в кровь^[6] а также иногда обнаруживается в сперме при извлечении в зиготу самки, которая связывается с рецептором α7-ацетилхолина.^[8]. Показано, что он действует как эндогенный опухолевый супрессор, уменьшая миграцию и инвазию клеток, опосредуя свой собственный противоопухолевый эффект и противодействуя злокачественным эффектам никотина.^[8]

Мутации в этом гене были связаны с Мал де Меледа, редкое аутосомно-рецессивное заболевание кожи, характеризующееся воспалительным ладонно-подошвенным гиперкератозом. Это следствие потери SLURP1, что приводит к дисфункциональной эпителиальной дифференцировке.^[9] и повышенная секреция воспалительных цитокинов TNFα, IL1, IL-6 и IL-8^[10][11].

Этот ген отображается в той же хромосомной области, что и несколько членов семейства гликопротеиновых рецепторов Ly6 / uPAR.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000126233 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022596 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фишер Дж., Буаджар Б., Хейлиг Р., Хубер М., Лефевр С., Джобард Ф., Макари Ф., Бакиджа-Консуо А., Айт-Белкасем Ф., Вайссенбах Дж., Латроп М., Холь Д., Пруд'хомм Дж. Ф. (апрель 2001 г.). «Мутации в гене, кодирующем SLURP-1, в Маль де Меледа». Молекулярная генетика человека. 10 (8): 875–80. Дои:10,1093 / hmg / 10,8,875. PMID  11285253.
6. Adermann K, Wattler F, Wattler S, Heine G, Meyer M, Forssmann WG, Nehls M (апрель 1999 г.). "Структурная и филогенетическая характеристика человеческого SLURP-1, первого секретируемого млекопитающего члена суперсемейства белков Ly-6 / uPAR". Белковая наука. 8 (4): 810–9. Дои:10.1110 / пс. 8.4.810. ЧВК  2144295. PMID  10211827.
7. «Ген Entrez: секретируемый SLURP1 домен LY6 / PLAUR, содержащий 1».
8. Throm VM, Männle D, Giese T., Bauer AS, Gaida MM, Kopitz J, Bruckner T., Plaschke K, Grekova SP, Felix K, Hackert T, Giese NA, Strobel O (февраль 2018 г.). «Эндогенный CHRNA7-лиганд SLURP1 как потенциальный опухолевый супрессор и антиникотиновый фактор при раке поджелудочной железы». Oncotarget. 9 (14): 11734–11751. Дои:10.18632 / oncotarget.24312. ЧВК  5837762. PMID  29545933.
9. Фавр Б., Плантар Л., Эшбах Л., Бракч Н., Кристен-Заех С., де Вирах П.А., сержант А., Хубер М., Холь Д. (февраль 2007 г.). «SLURP1 является поздним маркером дифференцировки эпидермиса и отсутствует у Mal de Meleda». Журнал следственной дерматологии. 127 (2): 301–8. Дои:10.1038 / sj.jid.5700551. PMID  17008884.
10. Сваминатан С., Буэла К.А., Кинчингтон П., Латроп К.Л., Мисава Х., Хендрикс Р.Л., Сваминатан С.К. (декабрь 2012 г.). «Klf4 регулирует экспрессию Slurp1, который действует как иммуномодулирующий пептид в роговице мыши». Исследовательская офтальмология и визуализация. 53 (13): 8433–46. Дои:10.1167 / iovs.12-10759. ЧВК  4113333. PMID  23139280.
11. Чернявский А.И., Галитовский В., Щепотин И.Б., Грандо С.А. (2014). «Противовоспалительное действие никотинергических пептидов SLURP-1 и SLURP-2 на эпителиальные клетки кишечника человека и иммуноциты». BioMed Research International. 2014: 609086. Дои:10.1155/2014/609086. ЧВК  4024406. PMID  24877120.

дальнейшее чтение

• Ридж Р.Дж., Слоан Н.Х. (январь 1996 г.). «Неполная N-концевая аминокислотная последовательность противоопухолевого белка мочи (ANUP) и противоопухолевый эффект N-концевого нонапептида уникального цитокина, присутствующего в гранулоцитах человека». Цитокин. 8 (1): 1–5. Дои:10.1006 / cyto.1996.0001. PMID  8742060.
• Фишер Дж., Буаджар Б., Хайлиг Р., Физамес С., Пруд'хомм Дж. Ф., Вайссенбах Дж. (1999). «Генетическая связь болезни Меледа с хромосомой 8qter». Европейский журнал генетики человека. 6 (6): 542–7. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5200254. PMID  9887370.
• Eckl KM, Stevens HP, Lestringant GG, Westenberger-Treumann M, Traupe H, Hinz B, Frossard PM, Stadler R, Leigh IM, Nürnberg P, Reis A., Hennies HC (январь 2003 г.). «Mal de Meleda (MDM), вызванный мутациями в гене SLURP-1 у пациентов из Германии, Турции, Палестины и Объединенных Арабских Эмиратов». Генетика человека. 112 (1): 50–6. Дои:10.1007 / s00439-002-0838-8. PMID  12483299. S2CID  317308.
• Marrakchi S, Audebert S, Bouadjar B, Has C, Lefèvre C, Munro C, Cure S, Jobard F, Morlot S, Hohl D, Prud'homme JF, Zahaf A, Turki H, Fischer J (март 2003 г.). «Новые мутации в гене, кодирующем секретируемый лимфоцитный антиген-6 / белок-1 активатора плазминогена урокиназного типа, связанный с рецептором-1 (SLURP-1), и описание пяти предковых гаплотипов у пациентов с Mal de Meleda». Журнал следственной дерматологии. 120 (3): 351–5. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2003.12062.x. PMID  12603845.
• Ху Г, Йилдирим М., Байсал В., Еребакан О., Йилмаз Э., Иналоз Х.С., Мартинез-Мир А., Кристиано А.М., Челеби Дж. Т. (июнь 2003 г.). «Повторяющаяся мутация в гене ARS (компонент B), кодирующем SLURP-1, в турецких семьях с mal de Meleda: свидетельство эффекта основателя». Журнал следственной дерматологии. 120 (6): 967–9. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2003.12248.x. HDL:10261/39458. PMID  12787122.
• Chimienti F, Hogg RC, Plantard L, Lehmann C, Brakch N, Fischer J, Huber M, Bertrand D, Hohl D (ноябрь 2003 г.). «Идентификация SLURP-1 как эпидермального нейромодулятора объясняет клинический фенотип Mal de Meleda». Молекулярная генетика человека. 12 (22): 3017–24. Дои:10,1093 / hmg / ddg320. PMID  14506129.
• Чарфеддин С., Мокни М., Бен Мусли Р., Элькарес Р., Бушлака С., Бубакер С., Гедамси С., Баккуш Д., Бен Осман А., Деллаги К., Абдельхак С. (декабрь 2003 г.). «Новая миссенс-мутация в гене, кодирующем SLURP-1, у пациентов с Mal de Meleda из северного Туниса». Британский журнал дерматологии. 149 (6): 1108–15. Дои:10.1111 / j.1365-2133.2003.05606.x. PMID  14674887. S2CID  22999382.
• Mastrangeli R, Donini S, Kelton CA, He C, Bressan A, Milazzo F, Ciolli V, Borrelli F, Martelli F, Biffoni M, Serlupi-Crescenzi O, Serani S, Micangeli E, El Tayar N, Vaccaro R, Renda T , Лисчиани Р., Росси М., Папоян Р. (2004). «Компонент B ARS: структурная характеристика, тканевая экспрессия и регуляция гена и белка (SLURP-1), связанных с Mal de Meleda». Европейский журнал дерматологии. 13 (6): 560–70. PMID  14721776.
• Мокни М., Чарфеддин С., Бен Мусли Р., Баккуш Д., Кааби Б., Бен Осман А., Деллаги К., Абдельхак С. (март 2004 г.). «Гетерозиготные проявления у женщин-носительниц Mal de Meleda». Клиническая генетика. 65 (3): 244–6. Дои:10.1111 / j.0009-9163.2004.00224.x. PMID  14756676. S2CID  46140052.
• Чао СК, Лай Ф.Дж., Ян М.Х., Ли Дж.Й. (апрель 2005 г.). «Мал де Меледа по-тайваньски». Журнал Медицинской ассоциации Formosan = Тайвань Йи Чжи. 104 (4): 276–8. PMID  15909066.
• Арредондо Дж., Чернявский А.И., Уэббер Р.Дж., Грандо С.А. (декабрь 2005 г.). «Биологические эффекты SLURP-1 на кератиноциты человека». Журнал следственной дерматологии. 125 (6): 1236–41. Дои:10.1111 / j.0022-202X.2005.23973.x. PMID  16354194.
• Арредондо Дж., Чернявский А.И., Грандо С.А. (октябрь 2007 г.). «Сверхэкспрессия SLURP-1 и -2 снижает онкогенное действие полученного из табака нитрозамина на иммортализованные эпителиальные клетки полости рта». Биохимическая фармакология. 74 (8): 1315–9. Дои:10.1016 / j.bcp.2007.06.026. ЧВК  2046218. PMID  17643396.