SPSB1 - SPSB1

SPSB1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2JK9, 3F2O
Идентификаторы
Псевдонимы	SPSB1, SSB-1, SSB1, домен рецептора splA / рианодина и блок SOCS, содержащий 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 611657 MGI: 1921896 ГомолоГен: 11832 Генные карты: SPSB1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п36.22 Начинать 9,292,894 бп[1] Конец 9,369,532 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 E2 Начинать 149,896,283 бп[2] Конец 149,955,043 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность убиквитин-протеинтрансферазы • связывание белков, связывание, участвующих в распознавании субстрата для убиквитинирования Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • SCF убиквитин-лигазный комплекс Биологический процесс • убиквитинирование белков • полиубиквитинирование белков • посттрансляционная модификация • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	80176	74646
Ансамбль	ENSG00000171621	ENSMUSG00000039911
UniProt	Q96BD6	Q9D5L7
RefSeq (мРНК)	NM_025106	NM_029035
RefSeq (белок)	NP_079382	NP_083311
Расположение (UCSC)	Chr 1: 9.29 - 9.37 Мб	Chr 4: 149.9 - 149.96 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

SOCS-бокс-белок 1, содержащий домен SPRY это белок что у людей кодируется SPSB1 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171621 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039911 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ван Д, Ли З, Мессинг Э.М., Ву Джи (апрель 2005 г.). «Содержащий домен SPRY SOCS-бокс-белок 1 (SSB-1) взаимодействует с MET и усиливает путь элемента ответа Erk-Elk-1-сыворотки, индуцированный фактором роста гепатоцитов». J Biol Chem. 280 (16): 16393–401. Дои:10.1074 / jbc.M413897200. PMID  15713673.
6. Кайл Б.Т., Шульман Б.А., Александр В.С., Никола Н.А., Мартин Х.М., Hilton DJ (июнь 2002 г.). «Коробка SOCS: история разрушения и деградации». Тенденции Biochem Sci. 27 (5): 235–41. Дои:10.1016 / S0968-0004 (02) 02085-6. PMID  12076535.
7. «Ген Entrez: домен рецептора SPSB1 splA / рианодина и блок SOCS, содержащий 1».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ву Дж.С., Имм Дж. Х., Мин СК и др. (2006). «Структурное и функциональное понимание области B30.2 / SPRY». EMBO J. 25 (6): 1353–63. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600994. ЧВК  1422157. PMID  16498413.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.