Трансляционно контролируемый опухолевый белок - Translationally-controlled tumor protein

TPT1-AS1
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTPT1-AS1, HRF, TCTP, p02, p23, опухолевый белок, трансляционно-контролируемый 1, антисмысловая РНК TPT1 1
Внешние идентификаторыOMIM: 600763 MGI: 104890 ГомолоГен: 55730 Генные карты: TPT1-AS1
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TPT1 211943 x at fs.png

PBB GE TPT1 207783 x at fs.png

PBB GE TPT1 216520 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

100190939

22070

Ансамбль

ENSG00000170919

ENSMUSG00000060126

UniProt

P13693

P63028

RefSeq (мРНК)

н / д

NM_009429

RefSeq (белок)

NP_001273201
NP_001273202
NP_003286

NP_033455

Расположение (UCSC)н / дн / д
PubMed поиск[1][2]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Трансляционно контролируемый опухолевый белок (TCTP) это белок что у людей кодируется TPT1 ген.[3][4][5] В TPT1 ген отображается 13q12-q1413 в Хромосома 13.[4] Человеческий ген состоит из пяти интроны и шесть экзоны, Ген TPT1 содержит промоутер с каноническим ТАТА-бокс и несколько промоторных элементов, которые хорошо сохраняются у млекопитающих.[6] Проба с репортерный ген проявляет сильную промоторную активность, сравнимую с вирусными промоторами.[7]

Белок TCTP также обозначается как Q23,[8] P21,[9] P23,[10] гистамин рилизинг-фактор (HRF),[11] и фортилин.[12] TCTP - это многофункциональный и высококонсервативный белок, повсеместно существующий у разных видов эукариот и широко распространенный в различных тканях и типах клеток.[13]

Человеческий трансляционно контролируемый опухолевый белок (hTCTP) представляет собой кальций-связывающий белок, связанный с ростом.[14]

История

Трансляционно контролируемый опухолевый белок был впервые обнаружен в 1989 году как последовательность кДНК, полученная из карциномы молочной железы человека. кДНК библиотека с доказательствами, полученными из контролируемого трансляцией, связанного с ростом опухолевого белка мыши TCTP.[15] Первоначально TCTP был описан как белок опухолевых клеток, связанный с ростом. Его мРНК накапливается в репрессированных трансляцией постполисомных мРНП-комплексах.[16]

Исследования 1997 года показали, что TCTP не является опухолевым или тканеспецифическим белком, но экспрессируется повсеместно от растений к млекопитающим.[17][18][19][20]

Характеристики

TCTP представляет собой белок 20-25 кДа, который широко и повсеместно экспрессируется в клетке.[14] Белок транскрибируется более чем в 500 различных тканях и типах клеток; Ген hTCTP является одним из 10 самых распространенных генов, экспрессируемых у людей, по данным исследования 1753 библиотек из различных типов тканей,[21] но значительно различались по количеству и соотношению выражений. Экспрессия ниже в почках и почечных клетках.[17] Это указывает на обширный контроль транскрипции и участие тканеспецифических факторов.[6]

В большинстве публикаций TCTP рассматривается как цитоплазматический белок, но также сообщалось о ядерной локализации, а также о внеклеточной активности; однако процесс секреция не найдено.[6]

Функция

Обилие и повсеместность указывают на то, что TCTP может выполнять важные первичные функции. Однако с 1980-х годов было обнаружено большое количество клеточных и биохимических функций. Большинство этих функций можно разделить на три группы.[14]

Связанные с ростом

TCTP обладает свойствами тубулин связывающий белок, который связывается с микротрубочками в зависимости от клеточного цикла.[22][23]

Временная сверхэкспрессия ТКОБ в HeLa клетки не позволили им пройти этопозид -индуцированный апоптоз.[12] Экспрессия TCTP в U2OS (эпителиальных клетках костной остеосаркомы человека) защищала их от гибели клеток, вызванной этопозидом при различных концентрациях и продолжительности воздействия.[12] Сверхэкспрессия ТКОБ подавлена каспаза-3 -подобная активность, оцениваемая по расщеплению флуорогенного субстрата.[12]

Уровни экспрессии TCTP подавлялись на уровне мРНК и белка во время подавления опухоли и при активации p53 и Сиах-1 очень хорошо известные противоопухолевые гены.[24][25] Подавление ТКОБ может вызвать реверсию опухоли и в сочетании с некоторыми лекарствами, которые снижают уровень ТХБ и приводят к уничтожению опухолевых клеток.[26] Нокдаун TCTP в первичных опухолевых клетках молочной железы приводит к увеличению экспрессии p53 и уменьшению количества стволовых раковых клеток.[27]

Снижение уровня TCTP (dTCTP) в Дрозофила уменьшает размер клеток, количество клеток и размер органов, что имитирует Дрозофила Реб (dRheb) мутантные фенотипы; человеческий TCTP (hTCTP) демонстрирует биохимические свойства, аналогичные dTCTP.

Связанный с иммунитетом

TCTP вызывал высвобождение гистамина у человека базофилы субпопуляции доноров, и это высвобождение зависело от IgE.[11][28]Экспрессия TCTP регулируется на двух разных уровнях: истощение ER кальция вызывает увеличение TCTP. мРНК Изобилие, повышенные концентрации кальция в цитозоле регулируют экспрессию генов на посттранскрипционном уровне.[17][29][30]

Снижение уровня белка миРНК в HTR-8 / SVneo (Homo sapiens клетки плаценты) было связано со снижением активности клеточного поглощения кальция и буферной способности.[6]

Связанные с раком

Трансляционно контролируемый опухолевый белок играет роль в реверсия опухоли и развитие.[31][32]

Трансляционно контролируемый опухолевый белок (TCTP / tpt1) является регулятором компартмента раковых стволовых клеток,[33] реверсия опухоли,[34][35] прогрессирование опухоли и некоторые формы воспалительных заболеваний.[11] Более того, TCTP был описан как белок, способствующий выживанию, антагонистический функции BAX.[36]

Структура

Выравнивание последовательностей TCTP из более чем 30 различных видов показывает высокую степень сохранности в течение длительного периода эволюции.[6]

Состав раствора ТХТФ из дрожжей, Schizosaccharomyces pombe был определен с помощью ЯМР-спектроскопии, которая показала, что этот белок структурно подобен двум небольшим шаперонам, не содержащим гуаниновых нуклеотидов, а именно Mss4 и Dss4.[37] Таким образом, TCTP и Mss4 / Dss4 теперь структурно сгруппированы в одно суперсемейство белков.[6]

Трансляционно контролируемый опухолевый белок (TCTP) участвует в широком спектре молекулярных взаимодействий с биологическими и небиологическими партнерами различного химического состава, такими как белки, пептиды, нуклеиновые кислоты, углеводы или небольшие молекулы. Таким образом, TCTP является важной и универсальной связующей платформой. Многие из этих межбелковых взаимодействий были подтверждены, хотя лишь немногие из них получили подробные структурные характеристики. В TCTP / tpt1 - Remodeling Signaling from Stem Cell to Disease основное внимание уделяется структурному анализу TCTP и обзору доступной литературы относительно его сети взаимодействия со структурной точки зрения. [38]

Взаимодействия

TCTP был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  2. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ Гросс Б., Гестель М., Бём Х, Белька Х (октябрь 1989 г.). «последовательность кДНК, кодирующая трансляционно контролируемый опухолевый белок человека». Исследования нуклеиновых кислот. 17 (20): 8367. Дои:10.1093 / nar / 17.20.8367. ЧВК  334973. PMID  2813067.
  4. ^ а б Макдональд С.М., Пазнекас В.А., Джабс Е.В. (июнь 1999 г.). «Хромосомная локализация опухолевого белка, трансляционно-контролируемого 1 (TPT1), кодирующего фактор высвобождения гистамина человека (HRF) до 13q12 -> q14». Цитогенетика и клеточная генетика. 84 (1–2): 128–9. Дои:10.1159/000015238. PMID  10343127. S2CID  38129789.
  5. ^ «Ген Entrez: опухолевый белок TPT1, трансляционно-контролируемый 1».
  6. ^ а б c d е ж Bommer UA, Thiele BJ (март 2004 г.). «Трансляционно контролируемый опухолевый белок (TCTP)». Международный журнал биохимии и клеточной биологии. 36 (3): 379–85. Дои:10.1016 / S1357-2725 (03) 00213-9. PMID  14687915.
  7. ^ Тиле Х., Бергер М., Ленцнер С., Кюн Х., Тиле Б.Дж. (октябрь 1998 г.). «Структура промотора и полная последовательность гена, кодирующего кроличий трансляционно контролируемый опухолевый белок (TCTP) P23». Европейский журнал биохимии / FEBS. 257 (1): 62–8. Дои:10.1046 / j.1432-1327.1998.2570062.x. PMID  9799103.
  8. ^ Томас Дж., Томас Дж., Лютер Х (сентябрь 1981 г.). «Транскрипционный и трансляционный контроль цитоплазматических белков после стимуляции сывороткой покоящихся клеток Swiss 3T3». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 78 (9): 5712–6. Bibcode:1981PNAS ... 78.5712T. Дои:10.1073 / пнас.78.9.5712. ЧВК  348838. PMID  6946510.
  9. ^ Енофски Р., Бергманн И., Браверман Г. (октябрь 1982 г.). «Виды матричной РНК частично в подавленном состоянии в клетках асцита саркомы мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 79 (19): 5876–80. Bibcode:1982PNAS ... 79.5876Y. Дои:10.1073 / пнас.79.19.5876. ЧВК  347013. PMID  6964392.
  10. ^ Бём Х, Бенндорф Р., Гестель М., Гросс Б., Нюрнберг П., Крафт Р., Отто А., Белька Х (август 1989 г.). «Связанный с ростом белок P23 асцитной опухоли Эрлиха: контроль трансляции, клонирование и первичная структура». Биохимия Интернэшнл. 19 (2): 277–86. PMID  2479380.
  11. ^ а б c Макдональд С.М., Рафнар Т., Лэнгдон Дж., Лихтенштейн Л.М. (август 1995 г.). «Молекулярная идентификация IgE-зависимого гистамин-рилизинг-фактора». Наука. 269 (5224): 688–90. Bibcode:1995Научный ... 269..688М. Дои:10.1126 / science.7542803. PMID  7542803.
  12. ^ а б c d Ли Ф, Чжан Д., Фудзисе К. (декабрь 2001 г.). «Характеристика фортилина, нового антиапоптотического белка». Журнал биологической химии. 276 (50): 47542–9. Дои:10.1074 / jbc.M108954200. PMID  11598139.
  13. ^ Рен С., Чен Т., Цзян Х, Ван И, Ху Ц. (декабрь 2014 г.). «Первая характеристика структуры гена и биологической функции для трансляционно контролируемого опухолевого белка иглокожих (TCTP)». Иммунология рыб и моллюсков. 41 (2): 137–46. Дои:10.1016 / j.fsi.2014.08.030. PMID  25193395.
  14. ^ а б c Фэн И, Лю Д., Яо Х, Ван Дж (ноябрь 2007 г.). «Структура раствора и картирование очень слабого сайта связывания кальция человеческого трансляционно контролируемого опухолевого белка с помощью ЯМР». Архивы биохимии и биофизики. 467 (1): 48–57. Дои:10.1016 / j.abb.2007.08.021. PMID  17897616.
  15. ^ Гросс Б., Гестель М., Бём Х, Белька Х (октябрь 1989 г.). «последовательность кДНК, кодирующая трансляционно контролируемый опухолевый белок человека». Исследования нуклеиновых кислот. 17 (20): 8367. Дои:10.1093 / nar / 17.20.8367. ЧВК  334973. PMID  2813067.
  16. ^ Читпатима С.Т., Макридес С., Бандйопадхьяй Р., Браверман Г. (март 1988 г.). «Нуклеотидная последовательность основной матричной РНК для полипептида 21 килодальтон, который находится под контролем трансляции в опухолевых клетках мышей». Исследования нуклеиновых кислот. 16 (5): 2350. Дои:10.1093 / nar / 16.5.2350. ЧВК  338237. PMID  3357792.
  17. ^ а б c Санчес Дж. К., Шаллер Д., Равье Ф., Голаз О, Жакуд С., Белет М., Уилкинс М. Р., Джеймс Р., Дешюсс Дж., Хохштрассер Д. (январь 1997 г.). «Трансляционно контролируемый опухолевый белок: белок, идентифицированный в нескольких неопухолевых клетках, включая эритроциты». Электрофорез. 18 (1): 150–5. Дои:10.1002 / elps.1150180127. PMID  9059837.
  18. ^ Bhisutthibhan J, Pan XQ, Hossler PA, Walker DJ, Yowell CA, Carlton J, Dame JB, Meshnick SR (июнь 1998 г.). «Трансляционно контролируемый гомолог опухолевого белка Plasmodium falciparum и его реакция с противомалярийным препаратом артемизинином». Журнал биологической химии. 273 (26): 16192–8. Дои:10.1074 / jbc.273.26.16192. PMID  9632675.
  19. ^ Ян Л., Фей К., Бридж Д., Саррас депутат (октябрь 2000 г.). «Книдарианский гомолог трансляционно контролируемого опухолевого белка (P23 / TCTP)». Гены развития и эволюция. 210 (10): 507–11. Дои:10.1007 / s004270000088. PMID  11180799. S2CID  10631675.
  20. ^ Сейдж-Оно К., Оно М, Харада Х, Камада Х (март 1998 г.). «Индуцированное темнотой накопление мРНК для гомолога трансляционно контролируемого опухолевого белка (TCTP) в Pharbitis». Физиология растений и клеток. 39 (3): 357–60. Дои:10.1093 / oxfordjournals.pcp.a029377. PMID  9588028.
  21. ^ Томпсон Х. Г., Харрис Дж. В., Уолд Б. Дж., Quake SR, Броди Дж. П. (октябрь 2002 г.). «Идентификация и подтверждение модуля коэкспрессируемых генов». Геномные исследования. 12 (10): 1517–22. Дои:10.1101 / гр. 418402. ЧВК  187523. PMID  12368243.
  22. ^ Gachet Y, Tournier S, Lee M, Lazaris-Karatzas A, Poulton T, Bommer UA (апрель 1999 г.). «Связанный с ростом, трансляционно контролируемый белок P23 обладает свойствами тубулинсвязывающего белка и временно связывается с микротрубочками во время клеточного цикла». Журнал клеточной науки. 112 (8): 1257–71. PMID  10085260.
  23. ^ Ярм ФР (сентябрь 2002 г.). «Фосфорилирование Plk регулирует стабилизирующий микротрубочки белок TCTP». Молекулярная и клеточная биология. 22 (17): 6209–21. Дои:10.1128 / MCB.22.17.6209-6221.2002. ЧВК  134017. PMID  12167714.
  24. ^ Cans C, Passer BJ, Shalak V, Nancy-Portebois V, Crible V, Amzallag N, Allanic D, Tufino R, Argentini M, Moras D, Fiucci G, Goud B, Mirande M, Amson R, Telerman A (ноябрь 2003 г.) . «Трансляционно контролируемый опухолевый белок действует как ингибитор диссоциации гуаниновых нуклеотидов на фактор элонгации трансляции eEF1A». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (24): 13892–7. Bibcode:2003PNAS..10013892C. Дои:10.1073 / пнас.2335950100. ЧВК  283517. PMID  14623968.
  25. ^ Риннерталер М., Яролим С., Херен Дж., Палле Е, Перью С., Клингер Х, Богенгрубер Е., Мадео Ф, Браун Р. Дж., Брайтенбах-Коллер Л., Брайтенбах М., Лаун П. (2016-06-01). «MMI1 (YKL056c, TMA19), дрожжевой ортолог трансляционно контролируемого опухолевого белка (TCTP), имеет апоптотические функции и взаимодействует как с микротрубочками, так и с митохондриями»). Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биоэнергетика. 1757 (5–6): 631–8. Дои:10.1016 / j.bbabio.2006.05.022. PMID  16806052.
  26. ^ Tuynder M, Fiucci G, Prieur S, Lespagnol A, Géant A, Beaucourt S, Duflaut D, Besse S, Susini L, Cavarelli J, Moras D, Amson R, Telerman A (октябрь 2004 г.). «Трансляционно контролируемый опухолевый белок является мишенью для реверсии опухоли». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (43): 15364–9. Bibcode:2004ПНАС..10115364Т. Дои:10.1073 / pnas.0406776101. ЧВК  523462. PMID  15489264.
  27. ^ Amson R, Pece S, Lespagnol A, Vyas R, Mazzarol G, Tosoni D, Colaluca I, Viale G, Rodrigues-Ferreira S, Wynendaele J, Chaloin O, Hoebeke J, Marine JC, Di Fiore PP, Telerman A (январь 2012 г. ). «Взаимная репрессия между P53 и TCTP». Природа Медицина. 18 (1): 91–9. Дои:10,1038 / 2546 нм. PMID  22157679. S2CID  22984419.
  28. ^ Bheekha-Escura R, MacGlashan DW, Langdon JM, MacDonald SM (сентябрь 2000 г.). «Человеческий рекомбинантный гистамин-рилизинг-фактор активирует человеческие эозинофилы и эозинофильную клеточную линию AML14-3D10». Кровь. 96 (6): 2191–8. Дои:10.1182 / кровь.V96.6.2191. PMID  10979965.
  29. ^ Сюй А., Беллами А.Р., Тейлор Дж. А. (сентябрь 1999 г.). «Экспрессия трансляционно контролируемого опухолевого белка регулируется кальцием как на транскрипционном, так и на посттранскрипционном уровне». Биохимический журнал. 342 (3): 683–9. Дои:10.1042/0264-6021:3420683. ЧВК  1220510. PMID  10477280.
  30. ^ Хагигхат Н.Г., Рубен Л. (март 1992 г.). «Очистка новых связывающих кальций белков из Trypanosoma brucei: свойства 22-, 24- и 38-килодальтонных белков». Молекулярная и биохимическая паразитология. 51 (1): 99–110. Дои:10.1016 / 0166-6851 (92) 90205-х. PMID  1565142.
  31. ^ Сюй Ю.К., Черн Дж.Дж., Цай Й, Лю М., Чой К.В. (2007). «Drosophila TCTP необходим для роста и пролиферации посредством регуляции dRheb GTPase». Природа. 445 (7129): 785–8. Bibcode:2007Натура.445..785H. Дои:10.1038 / природа05528. PMID  17301792. S2CID  4302643.
  32. ^ Tuynder M, Susini L, Prieur S, Besse S, Fiucci G, Amson R, Telerman A (2002). «Биологические модели и гены реверсии опухоли: клеточное репрограммирование через tpt1 / TCTP и SIAH-1». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (23): 14976–81. Bibcode:2002PNAS ... 9914976T. Дои:10.1073 / pnas.222470799. ЧВК  137530. PMID  12399545.
  33. ^ Amson R, Pece S, Lespagnol A, Vyas R, Mazzarol G, Tosoni D, Colaluca I, Viale G, Rodrigues-Ferreira S, Wynendaele J, Chaloin O, Hoebeke J, Marine JC, Di Fiore PP, Telerman A (декабрь 2011 г. ). «Взаимная репрессия между P53 и TCTP». Природа Медицина. 18 (1): 91–9. Дои:10,1038 / нм 2546. PMID  22157679. S2CID  22984419.
  34. ^ Tuynder M, Susini L, Prieur S, Besse S, Fiucci G, Amson R, Telerman A (ноябрь 2002 г.). «Биологические модели и гены реверсии опухоли: клеточное репрограммирование через tpt1 / TCTP и SIAH-1». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (23): 14976–81. Bibcode:2002PNAS ... 9914976T. Дои:10.1073 / pnas.222470799. ЧВК  137530. PMID  12399545.
  35. ^ Tuynder M, Fiucci G, Prieur S, Lespagnol A, Géant A, Beaucourt S, Duflaut D, Besse S, Susini L, Cavarelli J, Moras D, Amson R, Telerman A (октябрь 2004 г.). «Трансляционно контролируемый опухолевый белок является мишенью для реверсии опухоли». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (43): 15364–9. Bibcode:2004ПНАС..10115364Т. Дои:10.1073 / pnas.0406776101. ЧВК  523462. PMID  15489264.
  36. ^ а б Susini L, Besse S, Duflaut D, Lespagnol A, Beekman C, Fiucci G, Atkinson AR, Busso D, Poussin P, Marine JC, Martinou JC, Cavarelli J, Moras D, Amson R, Telerman A (август 2008 г.). «TCTP защищает от апоптозной гибели клеток, подавляя функцию bax». Гибель клеток и дифференциация. 15 (8): 1211–20. Дои:10.1038 / cdd.2008.18. PMID  18274553.
  37. ^ Thaw P, Baxter NJ, Hounslow AM, Price C, Waltho JP, Craven CJ (август 2001 г.). «Структура TCTP обнаруживает неожиданную связь с шаперонами, не содержащими гуаниновые нуклеотиды». Структурная биология природы. 8 (8): 701–4. Дои:10.1038/90415. PMID  11473261. S2CID  6451004.
  38. ^ Телерман А, Амсон Р. (2017). TCTP / tpt1 - ремоделирование передачи сигналов от стволовых клеток к заболеванию. Результаты и проблемы дифференцировки клеток. vol 64. pp. 9–46. Дои:10.1007/978-3-319-67591-6_2. ISBN  978-3-319-67590-9. PMID  29149402.
  39. ^ Лю Х., Пэн Х.В., Ченг Ю.С., Юань Х.С., Ян-Йен Х.Ф. (апрель 2005 г.). «Стабилизация и усиление антиапоптотической активности mcl-1 с помощью TCTP». Молекулярная и клеточная биология. 25 (8): 3117–26. Дои:10.1128 / MCB.25.8.3117-3126.2005. ЧВК  1069602. PMID  15798198.
  40. ^ Thébault S, Agez M, Chi X, Stojko J, Cura V, Telerman SB, Maillet L, Gautier F, Billas-Massobrio I, Birck C, Troffer-Charlier N, Karafin T, Honoré J, Senff-Ribeiro A, Montessuit S , Джонсон К.М., Джуин П., Чианферани С., Мартину Дж. К., Эндрюс Д. В., Амсон Р., Телерман А., Каварелли Дж. (Январь 2016 г.). «TCTP содержит BH3-подобный домен, который вместо ингибирования активирует Bcl-xL». Научные отчеты. 6: 19725. Bibcode:2016НатСР ... 619725Т. Дои:10.1038 / srep19725. ЧВК  4728560. PMID  26813996.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P13693 (Человеческий трансляционно-контролируемый опухолевый белок) на PDBe-KB.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P63028 (Трансляционно контролируемый опухолевый белок мыши) на PDBe-KB.