VPS45 - VPS45

VPS45
Идентификаторы
Псевдонимы	VPS45, H1, H1SCN5, VPS45A, VPS45B, VPS54A, VSP45, VSP45A, вакуумная сортировка белков 45 гомолог
Внешние идентификаторы	OMIM: 610035 MGI: 891965 ГомолоГен: 5250 Генные карты: VPS45
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q21.2 Начните 150,067,279 бп[1] Конец 150,145,329 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 F2.1 | 3 41,65 см Начните 95,999,832 бп[2] Конец 96,058,466 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • молекулярная функция Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • эндосома • аппарат Гольджи • эндосомная мембрана • мембрана • Мембрана Гольджи • клеточный компонент • синаптический пузырек Биологический процесс • транспорт белка • внутриклеточный транспорт белка • коагуляция крови • везикулярный транспорт • стыковка пузырьков, участвующих в экзоцитозе Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	11311	22365
Ансамбль	ENSG00000136631	ENSMUSG00000015747
UniProt	Q9NRW7	P97390
RefSeq (мРНК)	NM_001279353 NM_001279354 NM_001279355 NM_007259	NM_013841
RefSeq (белок)	NP_001266282 NP_001266283 NP_009190	NP_038869
Расположение (UCSC)	Chr 1: 150.07 - 150.15 Мб	Chr 3: 96 - 96,06 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, ассоциированный с вакуумной сортировкой белков 45 это белок что у людей кодируется VPS45 ген.^[5][6]

Функция

Везикул опосредованный сортировка белков играет важную роль в разделении внутриклеточных молекул на отдельные органеллы. Генетические исследования дрожжей выявили более 40 сортировка вакуолярного белка (VPS) гены, участвующие в транспорт везикул в вакуоли. Этот ген является членом семейства доменов Sec1 и демонстрирует высокую степень сходства последовательностей с Vps45 мыши, крысы и дрожжей. Точная функция этого гена неизвестна, но его высокая экспрессия в мононуклеарных клетках периферической крови предполагает его роль в транспортировке белков, включая медиаторы воспаления.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136631 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015747 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Певснер Дж., Хсу С.К., Хайд П.С., Шеллер Р.Х. (февраль 1997 г.). «Гомологи млекопитающих генов дрожжевой вакуолярной сортировки белков (vps), участвующие в переносе Гольджи в лизосомы». Ген. 183 (1–2): 7–14. Дои:10.1016 / S0378-1119 (96) 00367-8. PMID  8996080.
6. "Ген Entrez: VPS45 вакуолярный белок сортирующий 45 гомолог (S. cerevisiae)".

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Теллам JT, Джеймс DE, Стивенс TH, Piper RC (1997). «Идентификация белка, подобного Sec1p Гольджи млекопитающих, mVps45». J. Biol. Chem. 272 (10): 6187–93. Дои:10.1074 / jbc.272.10.6187. PMID  9045632.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Раджасекария П., Эйр Х. Дж., Стэнли К. К. и др. (1999). «Молекулярное клонирование и характеристика кДНК, кодирующей сортировку вакуолярного белка лейкоцитов человека (h1Vps45)». Int. J. Biochem. Cell Biol. 31 (6): 683–94. Дои:10.1016 / S1357-2725 (99) 00017-5. PMID  10404641.
• Нильсен Э., Кристофоридис С., Уттенвейлер-Джозеф С. и др. (2000). «Рабеносин-5, новый эффектор Rab5, образует комплекс с hVPS45 и рекрутируется в эндосомы через домен пальца FYVE». J. Cell Biol. 151 (3): 601–12. Дои:10.1083 / jcb.151.3.601. ЧВК  2185588. PMID  11062261.
• де Renzis S, Sönnichsen B, Zerial M (2002). «Двухвалентные эффекторы Rab регулируют субкомпартментную организацию и сортировку ранних эндосом». Nat. Cell Biol. 4 (2): 124–33. Дои:10.1038 / ncb744. PMID  11788822.
• Дулубова И., Ямагути Т., Гао Ю. и др. (2002). "Как Tlg2p / syntaxin 16 'ловит' Vps45". EMBO J. 21 (14): 3620–31. Дои:10.1093 / emboj / cdf381. ЧВК  126126. PMID  12110575.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Kim BY, Ueda M, Kominami E, et al. (2004). «Идентификация мышиных Vps16 и биохимическая характеристика комплекса Vps класса C млекопитающих». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 311 (3): 577–82. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.10.030. PMID  14623309.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.